Diffusion of membrane proteins

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-Nouvelle méthode pour la caractérisation des interactions entre les protéines insérées dans les bicouches.




Nouvelle méthode pour la caractérisation des interactions entre les protéines insérées dans les bicouches.

Nous avons incorporé des protéines dans des bicouches modèles et mesuré leur coefficient de diffusion D. Sa variation nous renseigne sur des interactions possibles entre les inclusions transmembrannaires. Nous pouvons désormais préciser le mode d’interaction entre deux protéines (dans une même bicouche ou dans des bicouches voisines), la distance à partir de laquelle l’interaction existe, estimer son énergie ainsi que la stoechiométrie. La méthode mise au point, très performante, fournit des informations supplémentaires par rapport à des méthodes plus souvent utilisées comme le Biacore. Contrairement au précédent, elle s’applique aussi aux protéines membranaires. Nous avons ainssi étudié l’interaction entre deux protéines, MexA & OprM, constitutives d’une pompe à efflux fonctionnant à travers la double membrane de la Pseudomonas Aeruginosa bactérie responsable de plus de 30% des infections nosocomiales. Nos résultats montrent qu’une interaction entre ces protéines situées dans des bicouches opposées apparaît pour une distance particulière entre deux bicouches, 20nm, égale à la séparation des deux membranes in vivo. Nous avons également déterminé la variation avec le pH du nombre de MexA accrochées à OprM. Ces résultats sont en accord avec des données cristallographiques. (PLoS ONE (2009))